La Secretaría de Investigación tiene como misión la coordinación y desarrollo de la función investigación, en la ejecución de planes, programas y proyectos tendientes al fortalecimiento de la producción y transferencia del conocimiento científico.
La Secretaría tiene como función favorecer la transferencia de conocimientos producidos por los institutos, unidades de investigación y docentes. Dirige y supervisa el otorgamiento de becas, subsidios, créditos educativos y otras modalidades que faciliten las actividades de formación, capacitación y perfeccionamiento de alumnos, graduados, docentes e investigadores.